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山西藥科職業學院繼續教育部始于1993年，前身是成人教育部，2012年7月更名為繼續教育部。繼續教育部負責學院函授教育工作，承擔中國藥科大學和沈陽藥科大學的成人高等學歷教育、山西省執業藥師繼續教育培訓等工作。 繼續教育部現有工作人員四名，設繼續教育部辦公室、教學科，在籍學生1000余人。二十年來，學院已培養出近4000余名畢業生，分布在全國各地醫藥戰線，很多人已取得了執業藥師認證資格，成為藥學領域的骨干，并且擔任了領導職務。目前舉辦的高等學歷教育層次為專科起點本科；辦學形式有：函授。 繼教部把教學質量視為生命線，嚴格執行各專業、各層次的教學計劃，具有嚴謹的學風、嚴明的紀律，培養具有成人特點的、社會急需的、高素質的應用型、技術型藥學專門人才。學院開設的課程由沈陽藥科大學和中國藥科大學審定，學校選派具有副教授以上職稱或取得碩士、博士學位的教師任教。學生學完教學計劃規定的全部課程，成績合格，學校發給國家教育部承認的畢業證書。本科函授學生通過學位英語考試、畢業論文和課程平均成績達到學士學位授予條件者，可授予學士學位。本、專科畢業生均可報考國家執業藥師。
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