學(xue)術橋訂閱號
學術橋服務號
如果腫瘤細胞剛(gang)剛(gang)生成,就可以被精(jing)準(zhun)地“揪(jiu)”出來(lai),那將給腫瘤的診斷和治療帶來(lai)巨大(da)變革。而要想實現這(zhe)一(yi)點,成像方式就必須具有極(ji)高(gao)的靈敏(min)度。
近日,中(zhong)(zhong)科(ke)院自動(dong)化研(yan)究(jiu)所、中(zhong)(zhong)科(ke)院分子影(ying)像重點實驗(yan)室在(zai)基于(yu)人(ren)工智能(AI)技術的新型成像方法研(yan)究(jiu)上獲得了(le)突破性進展——研(yan)究(jiu)人(ren)員將(jiang)小鼠顱內腦膠(jiao)質(zhi)瘤的三維定位精度,由(you)傳(chuan)統方法的百微米級誤(wu)差縮(suo)小到了(le)十微米級,為疾病動(dong)物模(mo)型乃至臨床患者的影(ying)像學(xue)研(yan)究(jiu)提供了(le)全新的思路。相關研(yan)究(jiu)論文(wen)已發(fa)表于(yu)《光(guang)》期刊。
“圖像(xiang)(xiang)(xiang)(xiang)不(bu)是(shi)憑空得(de)到的(de)(de)(de)(de)(de),而是(shi)成像(xiang)(xiang)(xiang)(xiang)設備獲得(de)的(de)(de)(de)(de)(de),傳(chuan)統方(fang)法往(wang)往(wang)不(bu)能提供最好的(de)(de)(de)(de)(de)成像(xiang)(xiang)(xiang)(xiang)質量。在(zai)人類(lei)認(ren)知(zhi)圖像(xiang)(xiang)(xiang)(xiang)之前,在(zai)成像(xiang)(xiang)(xiang)(xiang)信號轉(zhuan)化為(wei)圖像(xiang)(xiang)(xiang)(xiang)的(de)(de)(de)(de)(de)過程中,會損失很多關鍵信息,人工智能技術可以突(tu)破(po)這(zhe)一(yi)瓶頸。”論(lun)文第一(yi)作者、中科(ke)院自動化研(yan)究所副研(yan)究員王(wang)坤告訴《中國科(ke)學報》,通過建立新的(de)(de)(de)(de)(de)AI模(mo)型,把原始(shi)的(de)(de)(de)(de)(de)物理信號轉(zhuan)化為(wei)更(geng)(geng)加精確、更(geng)(geng)高(gao)分辨、更(geng)(geng)少偽(wei)影、更(geng)(geng)高(gao)信噪(zao)比的(de)(de)(de)(de)(de)高(gao)質量圖像(xiang)(xiang)(xiang)(xiang),無論(lun)是(shi)“人腦”還是(shi)“機器腦”,都(dou)可以更(geng)(geng)好地(di)識別、認(ren)知(zhi)和學習,這(zhe)就是(shi)此項研(yan)究帶來的(de)(de)(de)(de)(de)最本質的(de)(de)(de)(de)(de)創新。
一項極具(ju)挑戰(zhan)性的工作
腫(zhong)瘤(liu)的(de)早期發現并(bing)不容(rong)易,特別是某(mou)些惡(e)性腫(zhong)瘤(liu),潛伏(fu)期甚至長達(da)20年,當身(shen)體發出(chu)警報時,往往已經走到(dao)了中晚(wan)期。如何(he)實現早期微小腫(zhong)瘤(liu)的(de)精準檢測,及時觀測到(dao)腫(zhong)瘤(liu)細胞剛(gang)出(chu)現時產生的(de)某(mou)些特異性蛋白、酶甚至RNA,一直是科(ke)學家探索和研究的(de)方向。
“不過(guo),在現實的(de)(de)(de)物理世界中,能(neng)(neng)夠提供如此高靈(ling)敏度的(de)(de)(de)成(cheng)像媒介并不多。”王坤(kun)坦言(yan),目前公(gong)認最(zui)好的(de)(de)(de)是(shi)高能(neng)(neng)伽馬射線(xian)和無(wu)輻射的(de)(de)(de)光子(zi),但是(shi)基于伽馬探測(ce)的(de)(de)(de)放射性核(he)素(su)成(cheng)像成(cheng)本高,難以普及;光學成(cheng)像成(cheng)本低(di)廉,但大(da)都是(shi)二維(wei)圖(tu)像,缺乏(fa)三維(wei)信息。
“我們用人工智(zhi)能(neng)解(jie)決的就是光學成像(xiang)難以(yi)三維定量的問題。”王坤說,“也就是既(ji)可以(yi)高(gao)(gao)靈敏度地(di)看到(dao)有沒有腫(zhong)瘤,是哪種分(fen)子類(lei)型的腫(zhong)瘤,還可以(yi)高(gao)(gao)精(jing)確度地(di)知道腫(zhong)瘤在哪里(li),有多大規(gui)模。”
王(wang)坤(kun)提到的(de)(de)光(guang)(guang)學成像(xiang)是(shi)(shi)指生(sheng)(sheng)物(wu)(wu)自發(fa)光(guang)(guang)斷層(ceng)成像(xiang)技(ji)術,該(gai)技(ji)術是(shi)(shi)生(sheng)(sheng)物(wu)(wu)醫學成像(xiang)的(de)(de)重要(yao)手段,廣(guang)泛(fan)應用于疾病動物(wu)(wu)模型的(de)(de)影像(xiang)學研究。然而,由于光(guang)(guang)子(zi)在生(sheng)(sheng)物(wu)(wu)體內具有非均勻化的(de)(de)高(gao)散射和(he)高(gao)吸(xi)收的(de)(de)物(wu)(wu)理特(te)性(xing),通過探測動物(wu)(wu)體表的(de)(de)發(fa)光(guang)(guang)光(guang)(guang)斑(ban)來(lai)逆向重建出生(sheng)(sheng)物(wu)(wu)體內的(de)(de)光(guang)(guang)源位(wei)置(即(ji)腫瘤位(wei)置),是(shi)(shi)一項極具挑(tiao)戰(zhan)性(xing)的(de)(de)工(gong)作。
清華大(da)學(xue)醫學(xue)院生(sheng)物醫學(xue)工程系研究員羅建(jian)文告訴《中國科學(xue)報(bao)》,此前,光(guang)(guang)學(xue)斷層(ceng)重建(jian)問題(ti)(ti)大(da)多(duo)是(shi)基(ji)于模型的(de)方法(fa),包括正問題(ti)(ti)和逆問題(ti)(ti)的(de)求解。正問題(ti)(ti)的(de)求解一般是(shi)利用輻(fu)射傳輸方程或者(zhe)擴(kuo)散方程等模型來(lai)模擬光(guang)(guang)子在組(zu)織體中的(de)傳播過程,進而得(de)到系統矩陣;逆問題(ti)(ti)的(de)求解大(da)多(duo)采用一些優(you)化方法(fa),來(lai)獲得(de)體內(nei)光(guang)(guang)源的(de)具體信息,如位置、形態(tai)、強度(du)等。
“然而,這(zhe)種基于(yu)模(mo)型的(de)方法,勢(shi)必(bi)會受到模(mo)型近似的(de)影響,導(dao)致重建精(jing)度(du)降低。”羅(luo)建文(wen)強調。據了解,正問題和逆(ni)問題求(qiu)解的(de)兩種誤差(cha)(cha)疊加在一起,最終(zhong)導(dao)致光學(xue)斷層成(cheng)像對于(yu)動物體(ti)內腫(zhong)瘤的(de)三維定位具有數百(bai)微米到1毫米的(de)誤差(cha)(cha)。
機器(qi)學習帶來(lai)突破
為(wei)減少誤差(cha),王坤所(suo)在(zai)團(tuan)隊提(ti)出基于(yu)機器(qi)學習的(de)AI重(zhong)(zhong)建(jian):完全舍棄構(gou)(gou)建(jian)前向(xiang)模(mo)型去(qu)描(miao)述光子在(zai)生物(wu)(wu)體(ti)內(nei)的(de)傳播,通過(guo)(guo)構(gou)(gou)建(jian)大量的(de)仿真(zhen)數據集(ji)(ji),在(zai)仿真(zhen)數據上確定動物(wu)(wu)體(ti)表(biao)的(de)光斑(ban)和體(ti)內(nei)的(de)光源(yuan),再通過(guo)(guo)該數據集(ji)(ji)訓練計(ji)算機智能化學習體(ti)表(biao)光斑(ban)和體(ti)內(nei)光源(yuan)的(de)非線性關(guan)系,從而構(gou)(gou)建(jian)出適用于(yu)生物(wu)(wu)自(zi)發(fa)光斷(duan)層成(cheng)像的(de)AI模(mo)型,最終三(san)維(wei)重(zhong)(zhong)建(jian)活體(ti)動物(wu)(wu)荷(he)瘤模(mo)型內(nei)的(de)腫瘤三(san)維(wei)分(fen)布。
“此項研(yan)究首(shou)次將機器學(xue)(xue)習中的多層感知(zhi)機方(fang)法(fa)應(ying)用于光(guang)學(xue)(xue)斷(duan)層重建(jian),并且提出了自(zi)己的數據集構(gou)造(zao)方(fang)法(fa),實現(xian)了直(zhi)接由(you)數據到結(jie)果的跨(kua)模(mo)型創新框架(jia),使得重建(jian)定位誤差縮小到傳(chuan)統方(fang)法(fa)的十分之一,同時這也提示(shi)了可以用人工智能方(fang)法(fa)去解決光(guang)學(xue)(xue)斷(duan)層重建(jian)問題。”羅建(jian)文(wen)評價道。
不過,王坤強(qiang)調,生物(wu)自發光斷層成像涉及到腫瘤細胞的(de)(de)(de)基因編輯和改造,所以(yi)只能用在動物(wu)身上,不能用于人(ren)體(ti),但是他們發展出的(de)(de)(de)基于AI的(de)(de)(de)光學三(san)維重(zhong)建方(fang)法具有推廣性,理論(lun)上可以(yi)用在其它光學分(fen)子影像的(de)(de)(de)成像技術上,例如(ru)激發熒光成像、近紅外成像等等。因此,該方(fang)法本身具有很(hen)好的(de)(de)(de)臨(lin)床轉化應用能力。
數(shu)據收集與分(fen)析面臨(lin)挑戰
機器學習的基礎是數據,而對于生物醫學成像來(lai)說,構建(jian)大數據集(ji)是非常(chang)困難的事(shi)情(qing)。
“比如(ru)我們的(de)(de)這個(ge)(ge)(ge)研究,構建(jian)了(le)近8000個(ge)(ge)(ge)腦膠質瘤荷瘤的(de)(de)小(xiao)鼠模(mo)(mo)型來訓練我們的(de)(de)機器學習(xi)模(mo)(mo)型。如(ru)果真的(de)(de)讓生物學家去一個(ge)(ge)(ge)個(ge)(ge)(ge)構建(jian)原位腦膠質瘤小(xiao)鼠模(mo)(mo)型,需要很(hen)長時間,并(bing)投入巨大的(de)(de)人力和財力,是非常(chang)不(bu)切實際的(de)(de)。”王坤說。
“我們構建的(de)仿(fang)真數據,達到了(le)非常高的(de)精(jing)度,很好(hao)地模擬了(le)現(xian)實的(de)腫瘤(liu)動物(wu)。”王坤(kun)表(biao)示,他(ta)們用生(sheng)物(wu)學家構建的(de)真實腦膠(jiao)質(zhi)瘤(liu)小(xiao)(xiao)鼠來驗證訓練出(chu)來的(de)人(ren)工(gong)智能(neng)模型是否精(jing)確(que)可(ke)靠,最終(zhong)結果表(biao)明,新型人(ren)工(gong)智能(neng)方法對于腦膠(jiao)質(zhi)瘤(liu)的(de)三維(wei)定位誤(wu)差均(jun)小(xiao)(xiao)于80微(wei)米(mi),而傳統方法的(de)定位誤(wu)差為350微(wei)米(mi)以(yi)上(shang)。
不過,在實(shi)際臨床應用中,數(shu)(shu)(shu)據的收(shou)集和解析并(bing)不容(rong)易。羅建文表示,機器學(xue)習(xi)(xi)特(te)別(bie)是深度學(xue)習(xi)(xi),最重(zhong)要的就(jiu)是數(shu)(shu)(shu)據,包括(kuo)數(shu)(shu)(shu)據的質量和數(shu)(shu)(shu)量。目前在醫(yi)學(xue)成像領域,雖然收(shou)集到(dao)大量的數(shu)(shu)(shu)據比較容(rong)易,但是這些數(shu)(shu)(shu)據被標記(ji)后(hou)才能用于(yu)建模,受(shou)個體差異影響很大。由于(yu)不同醫(yi)生的診斷結果不同,數(shu)(shu)(shu)據的質量會受(shou)到(dao)影響,用它(ta)訓練出(chu)的網絡就(jiu)會存在問題(ti)。
同(tong)(tong)時,羅建文表示,在診(zhen)斷、治療(liao)、預后等一(yi)系列環節中,對于一(yi)些疾病的(de)(de)定性描述,不(bu)同(tong)(tong)的(de)(de)醫(yi)生也存(cun)在很(hen)大的(de)(de)自(zi)由度(du),很(hen)難統一(yi)說法(fa);不(bu)同(tong)(tong)品牌(pai)甚至同(tong)(tong)一(yi)品牌(pai)但不(bu)同(tong)(tong)型號的(de)(de)醫(yi)療(liao)設備采集到的(de)(de)圖像,也存(cun)在較大差異。這些不(bu)統一(yi)的(de)(de)數據,都會影響(xiang)深度(du)學習(xi)的(de)(de)分析結果。
“還有(you)一(yi)(yi)(yi)個重要(yao)的(de)因素就是模型的(de)因果(guo)性(xing)和可解釋(shi)性(xing)。”羅建(jian)(jian)文(wen)強調,“醫學(xue)與人的(de)生(sheng)命(ming)息息相(xiang)關,所以做任何(he)一(yi)(yi)(yi)件(jian)事(shi)都(dou)要(yao)有(you)理(li)有(you)據,都(dou)要(yao)有(you)因果(guo)推論的(de)關系。但是,做機器學(xue)習模型時,很容易陷(xian)入直(zhi)接對相(xiang)關性(xing)進(jin)行建(jian)(jian)模的(de)陷(xian)阱。相(xiang)關性(xing)建(jian)(jian)模涉及(ji)的(de)兩個因素未必有(you)直(zhi)接的(de)因果(guo)關系。得出的(de)模型,如何(he)解釋(shi)其結果(guo)的(de)意(yi)義,是一(yi)(yi)(yi)個很難處理(li)的(de)事(shi)情。”
臨床任重道遠
在羅建文看來,深度學習擅長處(chu)理的就(jiu)是(shi)高(gao)維度、稀疏的信號,圖像(xiang)就(jiu)是(shi)這(zhe)些信號中一種(zhong)有(you)代表性的形式(shi),因此,AI在醫學影(ying)像(xiang)處(chu)理上的應用(yong)必然是(shi)一個熱(re)點(dian)方向。
“醫學(xue)影(ying)像(xiang)處理(li)的(de)典型(xing)問題(ti)包括影(ying)像(xiang)分類、目標檢(jian)測、圖像(xiang)分割(ge)和影(ying)像(xiang)檢(jian)索(suo)等,都(dou)能(neng)對應(ying)到日常臨床應(ying)用里的(de)一些痛點或比(bi)較浪費人力的(de)問題(ti)。”羅建文建議,影(ying)像(xiang)醫師應(ying)該投入(ru)到AI技術(shu)的(de)學(xue)習和應(ying)用中,AI技術(shu)也許很(hen)快就(jiu)能(neng)協助影(ying)像(xiang)醫生完成一部分工(gong)作,也有潛(qian)力使現(xian)有的(de)工(gong)作得到提(ti)升。
不(bu)過,上海中醫藥大學附屬曙光醫院放(fang)射科主任詹松(song)華站(zhan)在(zai)醫生(sheng)的(de)角度表(biao)示(shi),AI在(zai)發現病變(bian)方面肯定大有(you)作為(wei),但是(shi)(shi)代替醫生(sheng)來處理,很難。“發現病變(bian)特(te)點,然后區別正常(chang)和(he)異常(chang),到底是(shi)(shi)炎癥還是(shi)(shi)腫(zhong)瘤,最終還是(shi)(shi)由(you)醫生(sheng)來做診斷(duan)。”
詹松華認為(wei),AI用于(yu)生物醫學影像的(de)方向(xiang)是(shi)(shi)對的(de),但(dan)是(shi)(shi)目前需(xu)(xu)要(yao)(yao)更多的(de)科研投入,需(xu)(xu)要(yao)(yao)將(jiang)醫師和工程師很(hen)好地整合(he)起來,AI人(ren)士需(xu)(xu)要(yao)(yao)傾聽臨床的(de)聲音,了解醫生的(de)切(qie)實需(xu)(xu)求(qiu)。另外,AI解決(jue)假陰性率是(shi)(shi)關(guan)鍵,要(yao)(yao)提高AI機器判斷的(de)確定(ding)性,從而為(wei)醫生省(sheng)時節(jie)力。
① 凡本(ben)站注(zhu)明“稿件來(lai)源(yuan):中國(guo)教育在(zai)(zai)線(xian)”的(de)所有文(wen)字、圖片和音視頻稿件,版權(quan)均(jun)屬本(ben)網(wang)所有,任(ren)何媒體(ti)、網(wang)站或個人未經本(ben)網(wang)協議授(shou)權(quan)不得(de)轉載、鏈接(jie)、轉貼(tie)或以(yi)其他(ta)方式復制(zhi)發表。已經本(ben)站協議授(shou)權(quan)的(de)媒體(ti)、網(wang)站,在(zai)(zai)下載使用時必須(xu)注(zhu)明“稿件來(lai)源(yuan):中國(guo)教育在(zai)(zai)線(xian)”,違者本(ben)站將依(yi)法追究責任(ren)。
② 本(ben)站注明稿(gao)(gao)(gao)件來源(yuan)為其他媒體的文(wen)/圖(tu)等(deng)稿(gao)(gao)(gao)件均為轉載稿(gao)(gao)(gao),本(ben)站轉載出于(yu)非商業(ye)性的教育和科研之目的,并不意味(wei)著(zhu)贊(zan)同其觀點或(huo)證實(shi)其內(nei)容的真實(shi)性。如轉載稿(gao)(gao)(gao)涉(she)及版權等(deng)問題,請作者在兩(liang)周內(nei)速來電或(huo)來函聯(lian)系(xi)。




中國教育在線
