北(bei)京(jing)(jing)時間2022年(nian)2月16日(ri),國(guo)際頂級學術(shu)刊物(wu)(wu)Cell在(zai)線發(fa)表了南(nan)京(jing)(jing)農(nong)業大學動物(wu)(wu)醫學院/前沿交(jiao)叉研(yan)(yan)究(jiu)(jiu)院聯合中山(shan)大學醫學院以(yi)及軍事(shi)獸醫研(yan)(yan)究(jiu)(jiu)所等國(guo)內外單位完成(cheng)的研(yan)(yan)究(jiu)(jiu)論(lun)(lun)文(wen):“Virome characterization of game animals in China reveals a spectrum of emerging pathogens”。論(lun)(lun)文(wen)共同(tong)通訊作(zuo)者為南(nan)京(jing)(jing)農(nong)業大學粟碩教(jiao)授(shou)(Lead contact)、中山(shan)大學施莽教(jiao)授(shou)、悉尼大學愛德華·霍爾姆斯教(jiao)授(shou)。南(nan)京(jing)(jing)農(nong)業大學博(bo)士研(yan)(yan)究(jiu)(jiu)生(sheng)(sheng)何婉(wan)婷、中山(shan)大學博(bo)士研(yan)(yan)究(jiu)(jiu)生(sheng)(sheng)侯新、南(nan)京(jing)(jing)農(nong)業大學碩士研(yan)(yan)究(jiu)(jiu)生(sheng)(sheng)趙晉(jin)為論(lun)(lun)文(wen)共同(tong)第(di)一(yi)作(zuo)者。這是南(nan)京(jing)(jing)農(nong)業大學首次以(yi)第(di)一(yi)通訊作(zuo)者單位在(zai)CELL發(fa)表研(yan)(yan)究(jiu)(jiu)成(cheng)果,也是我國(guo)動物(wu)(wu)傳染病防控領域的突破(po)性研(yan)(yan)究(jiu)(jiu)進(jin)展。

據統(tong)計,70%以上的人(ren)(ren)類(lei)(lei)傳染病(bing)(bing)(bing)病(bing)(bing)(bing)原來自動(dong)物。因此,研(yan)究(jiu)與人(ren)(ren)類(lei)(lei)或者家畜(chu)可能密(mi)切接(jie)觸的野(ye)生(sheng)動(dong)物病(bing)(bing)(bing)毒(du)攜(xie)帶(dai)情況與多(duo)樣(yang)性(xing),對(dui)人(ren)(ren)類(lei)(lei)和(he)家畜(chu)新發(fa)(fa)傳染病(bing)(bing)(bing)的防(fang)控至關重(zhong)要(yao)。該論文(wen)對(dui)來自中國20個(ge)省(sheng)份18個(ge)物種共1941只哺乳動(dong)物的樣(yang)本(ben)展(zhan)開了(le)系(xi)統(tong)的病(bing)(bing)(bing)毒(du)轉錄組研(yan)究(jiu),發(fa)(fa)現13個(ge)病(bing)(bing)(bing)毒(du)科中的102種病(bing)(bing)(bing)毒(du)可以感染哺乳動(dong)物(圖1),其中65種病(bing)(bing)(bing)毒(du)為首(shou)次(ci)發(fa)(fa)現存(cun)在(zai)于哺乳動(dong)物中,例如(ru):海貍(li)鼠輪狀病(bing)(bing)(bing)毒(du)(Coypu rotavirus)、穿(chuan)山甲瘟(wen)病(bing)(bing)(bing)毒(du)(Pangolin pestivirus)、竹鼠札(zha)幌病(bing)(bing)(bing)毒(du)(Bamboo rat sapovirus)等。該研(yan)究(jiu)極大的拓展(zhan)了(le)對(dui)多(duo)種野(ye)生(sheng)動(dong)物攜(xie)帶(dai)病(bing)(bing)(bing)毒(du)多(duo)樣(yang)性(xing)的認識,為人(ren)(ren)類(lei)(lei)和(he)家畜(chu)疫病(bing)(bing)(bing)預(yu)警和(he)防(fang)控提供了(le)重(zhong)要(yao)科學依據。

圖1:野生動(dong)物中攜(xie)帶的與脊椎動(dong)物相關(guan)的病毒
在本研(yan)究中(zhong)報道(dao)了(le)豪(hao)豬丁(ding)型(xing)冠(guan)狀(zhuang)(zhuang)病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)(du)(du)(du)(Deltacoronavirus HKU17),牛副(fu)流(liu)感病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)(du)(du)(du)3型(xing)(Bovine parainfluenza virus 3)、哺乳(ru)動(dong)(dong)物(wu)正腮腺(xian)炎病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)(du)(du)(du)5型(xing)(Mammalian orthorubulavirus 5)、H9N2亞型(xing)流(liu)感病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)(du)(du)(du)(Influenza A virus H9N2)等21種對(dui)人(ren)(ren)類和家畜(chu)具有潛在高(gao)傳(chuan)播風(feng)(feng)險的(de)(de)(de)病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)(du)(du)(du)。發現(xian)(xian)貉(he)(he)、果子貍、竹鼠(shu)、豪(hao)豬、刺(ci)猬等多(duo)種野(ye)生動(dong)(dong)物(wu)可攜(xie)帶冠(guan)狀(zhuang)(zhuang)病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)(du)(du)(du),其中(zhong)腹(fu)瀉(xie)的(de)(de)(de)貉(he)(he)樣本中(zhong)攜(xie)帶的(de)(de)(de)四株(zhu)新(xin)型(xing)犬冠(guan)狀(zhuang)(zhuang)病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)(du)(du)(du)(Canine coronavirus,CCoV)與最新(xin)報道(dao)的(de)(de)(de)可導(dao)致人(ren)(ren)類疾病(bing)(bing)(bing)的(de)(de)(de)重組CCoV毒(du)(du)(du)(du)(du)株(zhu)CCoV-HuPn-2018的(de)(de)(de)基(ji)因同(tong)源(yuan)性(xing)達93.65%-94.27%;基(ji)于病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)(du)(du)(du)刺(ci)突蛋白(Spike protein, S)中(zhong)的(de)(de)(de)非重組區域分析(xi)發現(xian)(xian)四株(zhu)新(xin)的(de)(de)(de)貉(he)(he)CCoV形成了(le)一(yi)個(ge)單獨(du)的(de)(de)(de)譜系(圖2)。因此,這種冠(guan)狀(zhuang)(zhuang)病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)(du)(du)(du)的(de)(de)(de)跨物(wu)種傳(chuan)播風(feng)(feng)險值得關注。本研(yan)究還發現(xian)(xian)了(le)多(duo)種高(gao)豐度的(de)(de)(de)輪狀(zhuang)(zhuang)病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)(du)(du)(du)(Rotavirus),包括A、B、C、D和I群(qun)。兔、貉(he)(he)、豪(hao)豬和海(hai)貍鼠(shu)等動(dong)(dong)物(wu)均(jun)攜(xie)帶輪狀(zhuang)(zhuang)病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)(du)(du)(du)A群(qun)。同(tong)時高(gao)豐度的(de)(de)(de)輪狀(zhuang)(zhuang)A群(qun)、C群(qun)和I群(qun)的(de)(de)(de)共感染在腹(fu)瀉(xie)的(de)(de)(de)貉(he)(he)中(zhong)發現(xian)(xian),提(ti)示輪狀(zhuang)(zhuang)病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)(du)(du)(du)存在跨物(wu)種傳(chuan)播和公共衛生風(feng)(feng)險。

圖2:貉CCoV的基因組(zu)重組(zu)與進化分(fen)析(xi)
盡管這些(xie)野(ye)生動物不一(yi)定(ding)是這些(xie)高風險(xian)病毒的存(cun)儲(chu)宿(su)(su)主(圖(tu)3),但可(ke)能會作(zuo)為中(zhong)間(jian)宿(su)(su)主通過跨物種(zhong)傳(chuan)(chuan)播,把病原(yuan)體(ti)傳(chuan)(chuan)播給人(ren)類和家畜。該(gai)研究結(jie)果(guo)還表明,一(yi)些(xie)看似健康(kang)的動物身上也(ye)可(ke)以攜帶(dai)和人(ren)類致病密切相關的病毒,并(bing)且在(zai)不同物種(zhong)之間(jian)持(chi)續傳(chuan)(chuan)播。這再次(ci)凸顯了交易、食用以及密切接觸野(ye)味動物的風險(xian),揭示野(ye)生動物作(zuo)為疾病出現的潛在(zai)驅動因素(su)的重(zhong)要(yao)性。同時,研究結(jie)果(guo)可(ke)為新發傳(chuan)(chuan)染病防控關口前移等(deng)重(zhong)大疫病防控政策制(zhi)定(ding)提供(gong)新的思路。

圖3:野生動(dong)物攜帶潛在(zai)人(ren)畜(chu)共患病(bing)病(bing)毒與(yu)宿主之(zhi)間的關(guan)聯分(fen)析
本研究受到國家自然科學基金優青基金(31922081)等項目(mu)支(zhi)持(chi)資(zi)助(zhu),同(tong)時貉冠狀病(bing)毒(du)流行病(bing)學研究得(de)到了國家重點研發計(ji)劃項目(mu)課題(ti)“畜禽冠狀病(bing)毒(du)的(de)流行傳播特征與遺傳演化規(gui)律(2021YFD1801101)”支(zhi)持(chi)資(zi)助(zhu)。
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