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重磅!國防科技大學天河超級計算機新冠藥物篩選取得新突破
2021-11-12 14:02
國防科技大學
作者:

  近日,國(guo)防科(ke)技大(da)學(xue)聯合中山大(da)學(xue)、海(hai)南大(da)學(xue)、國(guo)家超(chao)(chao)級計算天津中心、中國(guo)海(hai)洋大(da)學(xue)等單位,依托天河(he)新一代(dai)超(chao)(chao)級計算機的(de)超(chao)(chao)大(da)規模(mo)算力,實現了新冠應急藥物(有效降(jiang)低致死率和重癥率)的(de)快速篩選和發現。

  研(yan)發團隊使用國際領(ling)先(xian)的(de)(de)藥(yao)物(wu)-靶(ba)標(biao)結合精準評(ping)(ping)價(jia)(jia)計算(suan)(suan)方法,以(yi)新冠病毒的(de)(de)M-Pro和TMPRSS2等重(zhong)要靶(ba)點為研(yan)究(jiu)對(dui)象,對(dui)180萬種小分子(zi)與靶(ba)點的(de)(de)復(fu)合物(wu)展開大規模(mo)計算(suan)(suan)評(ping)(ping)價(jia)(jia),在(zai)一(yi)周內完成(cheng)了(le)50余萬個(ge)復(fu)雜分子(zi)動(dong)力學(xue)模(mo)擬任務,并(bing)篩選出98個(ge)化(hua)合物(wu),其中(zhong)50個(ge)化(hua)合物(wu)在(zai)生物(wu)活性測試中(zhong)表現出較高(gao)活性,命中(zhong)率達到(dao)51%,在(zai)當前國際上(shang)處(chu)于領(ling)先(xian)水平。

  團隊成員(yuan)先期篩選得到(dao)的(de)雙嘧達莫藥物已完(wan)成100多(duo)例的(de)臨床試驗,其結(jie)果(guo)表(biao)明:雙嘧達莫干(gan)預三周后(hou),新冠重型(xing)患者臨床癥狀明顯(xian)改善,達到(dao)87.5%的(de)出(chu)院(yuan)率(lv)(lv)(lv),明顯(xian)優于對照(zhao)組(zu)40%出(chu)院(yuan)率(lv)(lv)(lv),無死亡案例,無轉成危重型(xing)案例,該藥能提(ti)高(gao)治愈率(lv)(lv)(lv)并降低病亡率(lv)(lv)(lv)。該藥與阿(a)比多(duo)爾(er)合用(yong)后(hou),新冠普通型(xing)患者的(de)出(chu)院(yuan)率(lv)(lv)(lv)為100%,平均(jun)出(chu)院(yuan)時(shi)間為7天(tian),比阿(a)比多(duo)爾(er)單用(yong)提(ti)前了4天(tian),顯(xian)示出(chu)良(liang)好的(de)治療效果(guo)。

  根據實際測算,在天河新一代超級計算機的支撐下,基于自(zi)由(you)能(neng)(neng)微擾-絕對(dui)結(jie)合自(zi)由(you)能(neng)(neng)方(fang)法的藥物篩選效能(neng)(neng)提(ti)升(sheng)了200倍。該項(xiang)成果對(dui)于實現針(zhen)對(dui)突發疫(yi)情的快(kuai)速藥物響應,具有極為重要的現實意義。

  11月4日,美國計(ji)算(suan)機(ji)協會(ACM)公(gong)布,在天河新(xin)一代(dai)超(chao)(chao)級計(ji)算(suan)機(ji)上完成(cheng)的(de)(de)“基于自(zi)(zi)由(you)能(neng)微(wei)擾-絕對結合(he)自(zi)(zi)由(you)能(neng)方(fang)法(fa)的(de)(de)大規模新(xin)冠(guan)藥物虛擬(ni)篩選”工作成(cheng)功入圍(wei)2021年(nian)度的(de)(de)戈登(deng)貝爾(er)新(xin)冠(guan)特(te)別(bie)獎(jiang)(jiang),這(zhe)是我國首次入圍(wei)該特(te)別(bie)獎(jiang)(jiang)獎(jiang)(jiang)項。戈登(deng)貝爾(er)獎(jiang)(jiang)是世(shi)界高性能(neng)計(ji)算(suan)應用領(ling)域的(de)(de)最高學術(shu)獎(jiang)(jiang)項,被稱為“超(chao)(chao)算(suan)領(ling)域的(de)(de)諾貝爾(er)獎(jiang)(jiang)”。由(you)于新(xin)冠(guan)疫情的(de)(de)爆發,去年(nian)首次設(she)立了戈登(deng)貝爾(er)獎(jiang)(jiang)新(xin)冠(guan)特(te)別(bie)獎(jiang)(jiang),以表彰在“超(chao)(chao)算(suan)抗疫”方(fang)面取得的(de)(de)杰出研究成(cheng)果。

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