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　　2024年7月31日，西(xi)湖大學醫學院(yuan)、西(xi)湖實(shi)驗室解明岐團隊在Cell雜(za)(za)志(zhi)上發表了題為(wei)“Multi-layered computational gene networks by engineered tristate logics”的(de)(de)(de)(de)最新研究成果，首(shou)次提出(chu)利(li)用“三(san)態門”電(dian)路/邏輯來設計(ji)(ji)(ji)(ji)基因(yin)線路的(de)(de)(de)(de)策略(lve)(TriLoS)，為(wei)人體細(xi)(xi)(xi)胞(bao)(bao)(bao)編寫“代碼”，使(shi)其能(neng)夠(gou)開展智能(neng)生物(wu)計(ji)(ji)(ji)(ji)算和(he)(he)細(xi)(xi)(xi)胞(bao)(bao)(bao)療法。研究提出(chu)的(de)(de)(de)(de)TriLoS設計(ji)(ji)(ji)(ji)理(li)念(nian)，以“三(san)態門”為(wei)基本邏輯單元，成功(gong)升級了生物(wu)計(ji)(ji)(ji)(ji)算的(de)(de)(de)(de)“編輯語(yu)言”，使(shi)設計(ji)(ji)(ji)(ji)哺乳動物(wu)細(xi)(xi)(xi)胞(bao)(bao)(bao)計(ji)(ji)(ji)(ji)算的(de)(de)(de)(de) “基因(yin)軟件”能(neng)夠(gou)真正意(yi)義(yi)上模塊(kuai)化(hua)(hua)(hua)、邏輯最簡化(hua)(hua)(hua)和(he)(he)工(gong)程(cheng)化(hua)(hua)(hua)，從而實(shi)現(xian)單細(xi)(xi)(xi)胞(bao)(bao)(bao)的(de)(de)(de)(de)復(fu)雜(za)(za)邏輯計(ji)(ji)(ji)(ji)算網絡和(he)(he)細(xi)(xi)(xi)胞(bao)(bao)(bao)邏輯電(dian)路，更將“生物(wu)計(ji)(ji)(ji)(ji)算機”的(de)(de)(de)(de)概(gai)念(nian)應(ying)用于復(fu)雜(za)(za)代謝性疾(ji)病(bing)的(de)(de)(de)(de)治療，根(gen)據疾(ji)病(bing)的(de)(de)(de)(de)狀態使(shi)細(xi)(xi)(xi)胞(bao)(bao)(bao)可以及時(shi)啟動不(bu)同(tong)的(de)(de)(de)(de)定制化(hua)(hua)(hua)治療程(cheng)序。這項工(gong)作(zuo)對現(xian)代智能(neng)生物(wu)計(ji)(ji)(ji)(ji)算的(de)(de)(de)(de)發展及其在精(jing)準醫療領(ling)域的(de)(de)(de)(de)應(ying)用具(ju)有(you)重要意(yi)義(yi)。

　　文章(zhang)鏈接：//www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)00716-5

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　　2024年7月31日，西湖大(da)學醫學院、西湖實驗室郭天(tian)南團隊，聯合(he)浙江(jiang)省腫瘤醫院鄭(zheng)智國、朱筧青，浙江(jiang)大(da)學華(hua)躍進團隊，在Nature Communications上發表了卵巢癌蛋白組(zu)學新研(yan)究“Proteomic landscape of epithelial ovarian cancer”，建(jian)立了上皮性(xing)卵巢癌的多病理(li)類型(xing)蛋白質組(zu)學全景(jing)圖(tu)，為改進診斷和治療策(ce)略提供了新的見解。

　　文章(zhang)鏈接(jie)：//www.nature.com/articles/s41467-024-50786-z

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　　2024年8月1日，西湖大學工學院向(xiang)宇(yu)軒(xuan)團隊以“Stabilizing Interlayer Repulsion in Layered Sodium-Ion Oxide Cathodes via Hierarchical Layer Modification”為題在(zai)材(cai)(cai)料(liao)期刊Advanced Materials上(shang)發表研究成果，他(ta)們提出“多(duo)層級”材(cai)(cai)料(liao)修飾(shi)策略，旨在(zai)穩定鈉離子層狀(zhuang)氧(yang)化(hua)物材(cai)(cai)料(liao)的層間靜電(dian)斥力，從(cong)而抑(yi)制電(dian)極在(zai)高電(dian)壓處不(bu)利相變的發生。通過(guo)(guo)巧(qiao)妙地“植入”不(bu)同的微量元素到層狀(zhuang)金屬氧(yang)化(hua)物的鈉層、過(guo)(guo)渡金屬層和氧(yang)層中，有效地“鎖(suo)定”了材(cai)(cai)料(liao)結構(gou)，使(shi)其在(zai)充放電(dian)過(guo)(guo)程(cheng)中更加(jia)穩定。

　　文章鏈接：//doi.org/10.1002/adma.202407519

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　　2024年8月(yue)6日，西湖大學理學院石航團隊回(hui)顧了(le)親(qin)(qin)芳(fang)香(xiang)環(huan)π酸催化(hua)(hua)SNAr反(fan)應(ying)的(de)(de)發展(zhan)歷程，在Accounts of Chemical Research上發表(biao)題(ti)為(wei)“Nucleophilic Aromatic Substitution of Halobenzenes and Phenols with Catalysis by Arenophilic π Acids”的(de)(de)綜述(shu)文章(zhang)。石航課題(ti)組(zu)基于過渡金屬π配(pei)位(wei)活(huo)化(hua)(hua)策略，開發了(le)一系(xi)列親(qin)(qin)芳(fang)香(xiang)環(huan)π酸催化(hua)(hua)的(de)(de)烷基鹵代物和苯酚的(de)(de)SNAr反(fan)應(ying)。文章(zhang)總結部(bu)分指出了(le)領域內現存的(de)(de)挑戰，期望(wang)通過催化(hua)(hua)劑的(de)(de)開發和π配(pei)位(wei)活(huo)化(hua)(hua)機(ji)制(zhi)的(de)(de)研究而推(tui)動親(qin)(qin)芳(fang)香(xiang)環(huan)π酸應(ying)用(yong)的(de)(de)發展(zhan)。

　　文章鏈接(jie)：//pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39042917/

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　　2024年8月7日，西湖大學理學院(yuan)、人工光合作用與太(tai)陽能燃料(liao)中心孫立(li)成(cheng)團(tuan)隊(dui)在Journal of the American Chemical Society上(shang)發表(biao)了(le)(le)題(ti)為“Cluster-Level Heterostructure of PMo12/Cu for Efficient and Selective Electrocatalytic Hydrogenation of High-Concentration 5?Hydroxymethylfurfural”的(de)(de)(de)研(yan)究論文。研(yan)究團(tuan)隊(dui)通過在Cu納米(mi)線表(biao)面(mian)負載Keggin型磷鉬酸(H3PMo12O40，PMo12)團(tuan)簇(cu)(cu)，制備了(le)(le)團(tuan)簇(cu)(cu)級異(yi)質(zhi)(zhi)結(jie)構的(de)(de)(de)PMo12/Cu催(cui)(cui)化(hua)(hua)劑(ji)(ji)。該催(cui)(cui)化(hua)(hua)劑(ji)(ji)能夠將5-羥甲基糠醛(quan)(HMF)電(dian)催(cui)(cui)化(hua)(hua)加氫(qing)至(zhi)2,5-二羥甲基呋喃(nan)(BHMF)，并且在高(gao)底物(wu)濃度(1.0 M)下(xia)表(biao)現(xian)出前所未有的(de)(de)(de)高(gao)選擇(ze)性，法拉第(di)效率(lv)高(gao)達98%，BHMF的(de)(de)(de)生成(cheng)速率(lv)高(gao)達4.35 mmol cm–2 h–1。相關工作不僅(jin)為醛(quan)類(lei)化(hua)(hua)合物(wu)電(dian)催(cui)(cui)化(hua)(hua)選擇(ze)性加氫(qing)催(cui)(cui)化(hua)(hua)劑(ji)(ji)設計提供了(le)(le)新(xin)思路，還為電(dian)催(cui)(cui)化(hua)(hua)劑(ji)(ji)異(yi)質(zhi)(zhi)界(jie)面(mian)工程調控催(cui)(cui)化(hua)(hua)活性與選擇(ze)性帶來了(le)(le)更深(shen)的(de)(de)(de)認識。

　　文(wen)章鏈接：//pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.4c08205

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　　2024年8月8日，西湖大學理學院石航(hang)團(tuan)隊在JACS發表了題(ti)為“Amination of Aminopyridines via η6?Coordination Catalysis”的研究論(lun)文。石航(hang)課題(ti)組在研究中(zhong)發展了吡啶環(huan)的η6配位(wei)活化(hua)策(ce)(ce)略，建立了釕催化(hua)的氨基吡啶與烷基胺的SNAr反應(ying)，為雜芳環(huan)的官(guan)能團(tuan)轉化(hua)提供了新(xin)策(ce)(ce)略。

　　文(wen)章鏈接：//pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.4c07306

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　　2024年8月(yue)8日，西(xi)湖大(da)學(xue)(xue)工(gong)學(xue)(xue)院鞠峰團隊(dui)在2024年8月(yue)于環境領域國際期刊Environmental Science & Technology上以副封面發(fa)表了題為“Discovery of Candidatus Nitrosomaritimum as a new genus of ammonia oxidizing archaea widespread in anoxic saltmarsh intertidal aquifers”的(de)原創(chuang)性論文。研(yan)究團隊(dui)在中國江(jiang)蘇鹽城濕(shi)地的(de)潮間帶含(han)水層發(fa)現并(bing)命名了一個新的(de)AOA屬Candidatus Nitrosomaritimum，通過比(bi)較(jiao)基因組(zu)(zu)學(xue)(xue)與(yu)宏(hong)轉錄(lu)組(zu)(zu)學(xue)(xue)方法(fa)揭示了該新屬的(de)系統發(fa)育多樣性、分布規律及(ji)其在生物氮轉化中的(de)重(zhong)要作用。

　　文(wen)章鏈(lian)接：//pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.est.4c02321

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　　2024年(nian)8月12日，西(xi)湖大學(xue)生(sheng)命科學(xue)學(xue)院(yuan)、西(xi)湖實驗(yan)室(shi)唐(tang)鴻云團隊在EMBO Journal發表了(le)題(ti)為(wei)“Identification of BiP as a temperature sensor mediating temperature-induced germline sex reversal in?C. elegans”的(de)(de)(de)最新(xin)研究成果(guo)。利(li)用模式生(sheng)物秀麗隱桿線蟲(chong)(C. elegans)，研究人員首次(ci)發現(xian)溫(wen)(wen)度(du)(du)依(yi)賴型性(xing)(xing)別(bie)(bie)決定(ding)(ding)的(de)(de)(de)關鍵溫(wen)(wen)度(du)(du)感知(zhi)因子BiP介(jie)導(dao)線蟲(chong)生(sheng)殖(zhi)腺性(xing)(xing)別(bie)(bie)決定(ding)(ding)并解析(xi)不(bu)同性(xing)(xing)別(bie)(bie)決定(ding)(ding)模式轉換機制(zhi)。這一原創性(xing)(xing)發現(xian)部分(fen)解答(da)了(le)溫(wen)(wen)度(du)(du)依(yi)賴型性(xing)(xing)別(bie)(bie)決定(ding)(ding)領域的(de)(de)(de)關鍵問題(ti)，即溫(wen)(wen)度(du)(du)是如(ru)何被感知(zhi)并轉化為(wei)性(xing)(xing)別(bie)(bie)調控信號的(de)(de)(de)。同時(shi)也(ye)解析(xi)了(le)不(bu)同性(xing)(xing)別(bie)(bie)決定(ding)(ding)模式之間的(de)(de)(de)相互(hu)轉換的(de)(de)(de)機制(zhi)，為(wei)研究自然界中生(sheng)物個體(ti)靈活采用不(bu)同性(xing)(xing)別(bie)(bie)決定(ding)(ding)模式的(de)(de)(de)策略帶(dai)來(lai)了(le)全新(xin)的(de)(de)(de)理解。

　　文章鏈(lian)接：//www.embopress.org/doi/full/10.1038/s44318-024-00197-z

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　　2024年8月12日，西湖(hu)大(da)學(xue)醫學(xue)院、西湖(hu)實驗室施紅軍團隊在?Genome Medicine?雜志(zhi)上發表了(le)(le)(le)題為(wei)“ENU-based dominant genetic screen identifies contractile and neuronal gene mutations in congenital heart disease”的最新(xin)(xin)研(yan)究成果(guo)。該(gai)研(yan)究進行了(le)(le)(le)迄(qi)今為(wei)止(zhi)最大(da)規模(mo)的小鼠先(xian)(xian)(xian)(xian)心(xin)(xin)病(bing)(bing)(bing)(bing)(bing)正(zheng)向顯(xian)性遺傳(chuan)篩查。通(tong)過篩選一(yi)(yi)萬多(duo)例小鼠心(xin)(xin)臟，發現了(le)(le)(le)一(yi)(yi)千多(duo)例先(xian)(xian)(xian)(xian)心(xin)(xin)病(bing)(bing)(bing)(bing)(bing)，其疾病(bing)(bing)(bing)(bing)(bing)類型和分布(bu)與(yu)(yu)人群(qun)(qun)中(zhong)的先(xian)(xian)(xian)(xian)心(xin)(xin)病(bing)(bing)(bing)(bing)(bing)發病(bing)(bing)(bing)(bing)(bing)情況極為(wei)相(xiang)似，為(wei)鑒定新(xin)(xin)的先(xian)(xian)(xian)(xian)心(xin)(xin)病(bing)(bing)(bing)(bing)(bing)致(zhi)病(bing)(bing)(bing)(bing)(bing)基(ji)(ji)因(yin)提(ti)(ti)(ti)供(gong)了(le)(le)(le)基(ji)(ji)礎。該(gai)研(yan)究首(shou)先(xian)(xian)(xian)(xian)建立了(le)(le)(le)小鼠全基(ji)(ji)因(yin)組預(yu)(yu)期(qi)(qi)隨機突(tu)(tu)變(bian)模(mo)型，并(bing)將(jiang)實驗觀察(cha)到的突(tu)(tu)變(bian)頻率與(yu)(yu)預(yu)(yu)期(qi)(qi)隨機突(tu)(tu)變(bian)模(mo)型進行比對，鑒定與(yu)(yu)疾病(bing)(bing)(bing)(bing)(bing)顯(xian)著相(xiang)關的突(tu)(tu)變(bian)基(ji)(ji)因(yin)。同時(shi)，該(gai)研(yan)究首(shou)次對一(yi)(yi)千多(duo)例先(xian)(xian)(xian)(xian)心(xin)(xin)病(bing)(bing)(bing)(bing)(bing)人群(qun)(qun)攜帶的罕見顯(xian)性遺傳(chuan)突(tu)(tu)變(bian)進行基(ji)(ji)因(yin)層面的遺傳(chuan)負擔分析，并(bing)將(jiang)人類基(ji)(ji)因(yin)分析結果(guo)與(yu)(yu)小鼠遺傳(chuan)篩選的結果(guo)相(xiang)互驗證。研(yan)究結果(guo)提(ti)(ti)(ti)示，基(ji)(ji)因(yin)突(tu)(tu)變(bian)導致(zhi)的早期(qi)(qi)胎兒血(xue)流動(dong)力學(xue)改變(bian)可(ke)能是先(xian)(xian)(xian)(xian)天(tian)性心(xin)(xin)臟病(bing)(bing)(bing)(bing)(bing)的重要風險因(yin)素(su)，并(bing)進一(yi)(yi)步(bu)提(ti)(ti)(ti)出了(le)(le)(le)多(duo)基(ji)(ji)因(yin)致(zhi)病(bing)(bing)(bing)(bing)(bing)模(mo)型，其中(zhong)包括(kuo)心(xin)(xin)臟收縮(suo)和神(shen)經調控基(ji)(ji)因(yin)，為(wei)先(xian)(xian)(xian)(xian)心(xin)(xin)病(bing)(bing)(bing)(bing)(bing)的預(yu)(yu)防和診斷提(ti)(ti)(ti)供(gong)了(le)(le)(le)一(yi)(yi)個全新(xin)(xin)的視(shi)角。

　　文章鏈接：

　　//genomemedicine.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13073-024-01372-x??

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　　2024年8月14日，西湖大(da)學生命科學學院、西湖實驗室裴端卿團隊(dui)在(zai)Nucleic Acids Research發(fa)表題為“ALKBH5 Governs human Endoderm Fate by Regulating the DKK1/4-mediated Wnt/β-catenin Activation”的(de)(de)研(yan)(yan)究論(lun)文，該研(yan)(yan)究首次揭示(shi)了(le)ALKBH5在(zai)人體(ti)外早期內胚層(ceng)發(fa)育過(guo)程(cheng)中的(de)(de)調控作(zuo)用及其分子(zi)機制，并系(xi)統地闡(chan)述了(le)“ALKBH5-GATA6-DKK1/4-Wnt/β-catenin”這條對于早期內胚層(ceng)命運決定(ding)不(bu)可或缺(que)的(de)(de)調控路線。此外，這項工作(zuo)還報道了(le)經典Wnt通(tong)路負(fu)向(xiang)調節因子(zi)DKK1/4在(zai)該體(ti)系(xi)中對Wnt/β-catenin信(xin)號(hao)通(tong)路的(de)(de)新(xin)型調控模式。

　　文章(zhang)鏈接(jie)：//academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkae707/7738000?login=true

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　　2024年8月19日(ri)，中山大學陳永(yong)明教(jiao)授(shou)(shou)、劉利新教(jiao)授(shou)(shou)聯合西湖大學工學院助理教(jiao)授(shou)(shou)張越(yue)在(zai)Nature Nanotechnology上發表了(le)題(ti)為“Synthetic polypeptides inhibit nucleic acid-induced inflammation in autoimmune diseases by disrupting multivalent TLR9 binding to LL37-DNA bundles”論文，報道(dao)了(le)針對自身免疫病的(de)一(yi)種潛在(zai)治療策略，即使用(yong)陽離(li)子聚多肽清除(chu)患者體(ti)內游離(li)的(de)自體(ti)核酸(cell free DNA, cfDNA)，從而阻(zu)斷自體(ti)核酸對Toll樣受(shou)體(ti)9(TLR9)的(de)異常(chang)激活和(he)炎癥反應(ying)。

　　文章鏈接：//www.nature.com/articles/s41565-024-01759-2

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　　2024年8月19日，西湖大學(xue)工學(xue)院(yuan)仇旻教授(shou)團隊以“Precise and omnidirectional opto-thermo-elastic actuation in van der Waals contacting systems”為題，在(zai)Advanced Science發表研究成果，他們提出了一(yi)種在(zai)平坦固體界面上實現高精度光(guang)學(xue)微(wei)操控(kong)的(de)技(ji)術，該操控(kong)技(ji)術可以驅動(dong)原本粘附在(zai)襯(chen)底上的(de)材(cai)料在(zai)平面內實現任意方向、亞納米精度的(de)移動(dong)。

　　文(wen)章鏈接(jie)：//onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/advs.202401418

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　　2024年8月20日(ri)，西湖大(da)學(xue)(xue)工學(xue)(xue)院陸啟陽團(tuan)隊(dui)在JACS上(shang)以“Deconvoluting Surface and Bulk Charge Storage Processes in Redox-Active Oxides by Integrating Electrochemical and Optical Insights”為題發(fa)表研究成果(guo)，他(ta)們基于耦合(he)電化學(xue)(xue)與(yu)光學(xue)(xue)原位表征的方法，提出了(le)一(yi)種新的模型，能夠精確區分并(bing)量(liang)化表面(mian)與(yu)體相(xiang)的電荷儲存行為。

　　文章鏈接：//doi.org/10.1021/jacs.4c09261

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　　2024年8月20日，西湖大(da)學(xue)醫(yi)學(xue)院郭天南團隊聯合(he)中(zhong)國人民解放軍第二軍醫(yi)大(da)學(xue)長海醫(yi)院楊成華、高旭團隊，共同在(zai)Cell Reports Medicine發(fa)(fa)表了(le)題目為(wei)“Proteomic landscape profiling of primary prostate cancer reveals a 16-protein panel for prognosis prediction” 的(de)前(qian)列(lie)腺癌(ai)蛋(dan)白(bai)(bai)組學(xue)新研究。文章鑒定了(le)三(san)種具有(you)顯著臨床(chuang)和蛋(dan)白(bai)(bai)質(zhi)譜特(te)征的(de)前(qian)列(lie)腺癌(ai)分子(zi)亞型;提(ti)出并驗證了(le)一個由16種蛋(dan)白(bai)(bai)質(zhi)組成的(de)前(qian)列(lie)腺癌(ai)預(yu)后預(yu)測(ce)模型，該模型能夠(gou)有(you)效預(yu)測(ce)前(qian)列(lie)腺癌(ai)(PCa)患者的(de)生化復發(fa)(fa)，其預(yu)測(ce)效能優(you)于(yu)(yu)現(xian)有(you)的(de)基(ji)于(yu)(yu)臨床(chuang)參數(shu)的(de)預(yu)測(ce)方(fang)法(fa)，可為(wei)高風(feng)險(xian)前(qian)列(lie)腺癌(ai)盡早提(ti)供(gong)有(you)效的(de)治(zhi)療(liao)干預(yu)措施提(ti)供(gong)指導;發(fa)(fa)現(xian)NUDT5和SEPTIN8可作(zuo)為(wei)潛在(zai)的(de)前(qian)列(lie)腺癌(ai)聯合(he)治(zhi)療(liao)靶(ba)點。

　　文(wen)章鏈接：//www.cell.com/cell-reports-medicine/fulltext/S2666-3791(24)00400-2

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　　2024年8月24日，西(xi)湖(hu)大學(xue)生命(ming)科學(xue)學(xue)院、西(xi)湖(hu)實驗室裴(pei)端卿團隊在Nature?Communications雜志發(fa)(fa)表研究論文，發(fa)(fa)現在體外(wai)細胞光-電實驗中，額外(wai)添加ATR會增強ChR2產生的(de)電信號，但減弱了(le)KCR1產生的(de)電信號。這一現象揭示了(le)內(nei)源(yuan)的(de)ChR2/KCR1(endoChR2/KCR1)和(he)添加外(wai)源(yuan)ATR的(de)ChR2/KCR1(exoChR2/KCR1)必然存(cun)在分子機制上的(de)差異。并且(qie)，加入(ru)外(wai)源(yuan)ATR后表達ChR2/KCR1細胞出現肉眼可見的(de)顏色變(bian)化(hua)，且(qie)純化(hua)后的(de)endoChR2/KCR1和(he)exoChR2/KCR1蛋白同樣呈現不同的(de)顏色，說明哺乳動物內(nei)源(yuan)發(fa)(fa)色團不是簡(jian)單的(de)ATR。

　　文(wen)章鏈(lian)接：//www.nature.com/articles/s41467-024-51811-x

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　　2024年8月(yue)26日，西(xi)湖大學工學院(yuan)姜漢卿(qing)團隊以“Energy-efficient dynamic 3D metasurfaces via spatiotemporal jamming interleaved assemblies for tactile interfaces”為題在Nature Communications發表研究成果。他們提出了一種三維超表面設計(ji)的新(xin)策略，其可實現動態(tai)刷(shua)新(xin)且(qie)不依賴持(chi)續的能(neng)量(liang)輸入，可用(yong)于觸覺界面的設計(ji)。

　　文章(zhang)鏈接：//www.nature.com/articles/s41467-024-51865-x

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　　2024年8月29日，西湖(hu)大(da)學(xue)生命科學(xue)學(xue)院、西湖(hu)實驗(yan)室裴(pei)端卿團隊在 Nature?Communications?發表題為“Activation mechanisms of dimeric mechanosensitive OSCA/TMEM63 channels”的(de)研究論文，揭示了(le)OSCA/TMEM63的(de)全(quan)激活機(ji)理。

　　文(wen)章鏈接：//www.nature.com/articles/s41467-024-51800-0

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　　2024年(nian)8月29日，西(xi)湖大(da)學(xue)理學(xue)院吳(wu)頡(jie)團(tuan)隊(dui)與王(wang)鴻飛團(tuan)隊(dui)和(he)工學(xue)院陸啟陽團(tuan)隊(dui)合作在Advanced Science上發表了(le)(le)題為“Polar Metallicity Controlled by Epitaxial Strain Engineering”的研(yan)究論文。吳(wu)頡(jie)團(tuan)隊(dui)在研(yan)究中(zhong)證明，極化(hua)金屬(shu)性可以通(tong)(tong)(tong)過(guo)控制(zhi)施加于NdNiO3薄(bo)(bo)膜的外延應(ying)力和(he)控制(zhi)薄(bo)(bo)膜的厚度來進一步設計和(he)優(you)化(hua)。認為通(tong)(tong)(tong)過(guo)外延應(ying)力誘(you)導(dao)電極化(hua)性質的思(si)路應(ying)該是普適(shi)的，適(shi)用(yong)于多種鈣鈦(tai)礦過(guo)渡(du)(du)金屬(shu)氧(yang)化(hua)物(wu)。這使得通(tong)(tong)(tong)過(guo)外延應(ying)力將電極化(hua)性質鐵磁(ci)以及超導(dao)性等(deng)融合于同一鈣鈦(tai)礦過(guo)渡(du)(du)金屬(shu)氧(yang)化(hua)物(wu)材料(liao)體(ti)系成為了(le)(le)可能，為設計和(he)合成多功能過(guo)渡(du)(du)金屬(shu)氧(yang)化(hua)物(wu)材料(liao)開辟了(le)(le)一個新的途(tu)徑。

　　文(wen)章鏈接：//doi.org/10.1002/advs.202408329

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　　近日，西湖大(da)學工學院齊國(guo)君團隊提出了一種名為均衡擴(kuo)散(Equilibrated Diffusion)的圖(tu)像(xiang)定制(zhi)方法，該方法利(li)用頻(pin)率感知的文(wen)(wen)本(ben)嵌入和掩碼引導的擴(kuo)散過(guo)程(cheng)，通過(guo)殘差(cha)參(can)考注(zhu)意力(li)機制(zhi)增強圖(tu)像(xiang)與文(wen)(wen)本(ben)的一致性。該論文(wen)(wen)被A類國(guo)際學術(shu)會(hui)議(yi)ACM Multimedia 2024錄用，并入選口頭報告(Oral，比例(li)3.97%)。論文(wen)(wen)地(di)址：//openreview.net/pdf?id=ERuypCHYvX代碼地(di)址：//github.com/maple-research-lab/EqDiff

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　　2024年9月2日，西湖大(da)學理學院王兆彬團隊在Angew. Chem. Int. Ed.上(shang)發表(biao)了題為(wei)“Radical-Based Enantioconvergent Reductive Couplings of Racemic Allenes and Aldehydes”的研(yan)究論(lun)文。研(yan)究團隊基于光氧(yang)化還(huan)原(yuan)(yuan)、鉻和鈷的三(san)催化體系，成功實現了消旋(xuan)聯烯與(yu)醛(quan)的對(dui)映(ying)匯聚式的還(huan)原(yuan)(yuan)偶聯反應。

　　文章鏈接：//onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202413198

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　　2024年9月3日，西(xi)湖(hu)大(da)學工學院李文彬團隊(dui)(dui)與(yu)李子青團隊(dui)(dui)合(he)作，在JACS Au上發(fa)(fa)表題為“Aggregation Rules of Short Peptides”的(de)研究成果。他們(men)聯合(he)開發(fa)(fa)了(le)一種(zhong)基(ji)于Transformer架構(gou)的(de)人工智能(Artificial Intelligence, AI)模型(xing)，用(yong)于預測(ce)四肽及五肽的(de)聚集(ji)傾(qing)向性(Aggregation Propensity, AP)。該研究量化了(le)每(mei)個(ge)氨基(ji)酸對肽聚集(ji)傾(qing)向性的(de)貢獻度(du)，為理解(jie)特定氨基(ji)酸如何影響聚集(ji)過程提供了(le)深(shen)入見(jian)解(jie)。

　　文章鏈接：//pubs.acs.org/doi/10.1021/jacsau.4c00501

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　　2024年9月12日(ri)，西湖(hu)大學理學院鄧力團(tuan)(tuan)隊(dui)在JACS上發表(biao)了(le)題為(wei)“Synthesis of?α-Aminonitriles via Ammonium-catalyzed Reactions of Aminoacetonitrile”的研(yan)究論文。鄧力教授團(tuan)(tuan)隊(dui)開發了(le)一種(zhong)α-氨腈的綠色(se)合成策略。該策略選用(yong)廉(lian)價易得且無毒的氨基乙(yi)腈鹽(yan)(yan)酸鹽(yan)(yan)為(wei)起(qi)始原料，操作簡(jian)單，廣泛(fan)適用(yong)于結構多樣的α-氨腈合成，可放大生產，可衍生合成，因此具有發展成為(wei)通用(yong)性α-氨腈綠色(se)合成的前景。

　　文章鏈接：//pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.4c09789

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　　2024年(nian)9月18日，西湖大學理學院、人工光合(he)作用(yong)(yong)與(yu)太(tai)陽(yang)能燃料中心段(duan)樂樂團(tuan)隊在Angew. Chem. Int. Ed.上發表了題為“Metal-Free Wet Chemistry for the Fast Gram-Scale Synthesis of γ-Graphyne and its Derivatives”的(de)研(yan)究(jiu)文章。段(duan)樂樂課(ke)題組成功開發了無金屬(shu)參(can)與(yu)的(de)親核交聯濕化學法路徑，用(yong)(yong)于(yu)GY的(de)克級快速合(he)成。該合(he)成策略(lve)具(ju)有良(liang)好的(de)官能團(tuan)耐(nai)受性(xing)和底(di)物普適性(xing)，并已擴展到(dao)制備多種富(fu)氟(fu)(fu)和/或(huo)富(fu)氮(dan)的(de)GY衍(yan)生物。特別是以(yi)六氟(fu)(fu)苯(ben)為反應底(di)物快速合(he)成GY及其衍(yan)生物的(de)實驗，降低了材料合(he)成的(de)時間和經濟成本(ben)，顯示出極大的(de)應用(yong)(yong)潛(qian)力，這將有利(li)于(yu)推動該類碳材料在催化以(yi)外領域的(de)應用(yong)(yong)研(yan)究(jiu)，為創新碳材料的(de)發展鋪平了道路。

　　文(wen)章鏈接：//onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/anie.202411228

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　　近日，西湖大學(xue)工學(xue)院袁鑫團(tuan)隊提出隱式擴(kuo)散先(xian)驗增強(qiang)的(de)(de)深(shen)(shen)度(du)展(zhan)開網絡(luo)(luo)，引(yin)入了一種生成式的(de)(de)隱式擴(kuo)散模型，通過(guo)在(zai)生成的(de)(de)無退化的(de)(de)知識先(xian)驗來增強(qiang)基于回歸的(de)(de)深(shen)(shen)度(du)展(zhan)開網絡(luo)(luo)。該論文被計算機視覺頂級會議ECCV 2024錄用(yong)，并入選口(kou)頭(tou)報(bao)告(Oral，比例約為2.3%)。

　　代碼地址(zhi)：//github.com/Zongliang-Wu/LADE-DUN

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　　近日，西(xi)湖大(da)學工學院楊(yang)林團(tuan)隊(dui)和林濤(tao)團(tuan)隊(dui)提出最大(da)規模、專家驗證的高質量病理大(da)模型(xing)測試基準數據集(ji)PathMMU。該論文(wen)被計算(suan)機視覺頂(ding)級會議ECCV 2024錄(lu)用，并入選口頭報告(Oral，接受率約為2.3%)。

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　　2024年9月(yue)28日，西湖(hu)大學工(gong)學院Thomas Wanger團隊受(shou)邀在(zai)Nature Communications期刊上發(fa)表了一篇(pian)綜述論文，通過系統評價對(dui)(dui)已知和(he)(he)(he)潛(qian)在(zai)的(de)(de)(de)納米(mi)(mi)/微米(mi)(mi)塑料(liao)的(de)(de)(de)暴露途徑進(jin)行了量化，并研(yan)究了其(qi)對(dui)(dui)昆蟲傳粉(fen)者和(he)(he)(he)生(sheng)(sheng)物防治媒介的(de)(de)(de)直接(jie)(jie)和(he)(he)(he)間(jian)接(jie)(jie)影響(xiang)(xiang)。該(gai)論文重(zhong)點關注了納米(mi)(mi)/微米(mi)(mi)塑料(liao)污染對(dui)(dui)個(ge)體、農場和(he)(he)(he)景觀層面的(de)(de)(de)直接(jie)(jie)和(he)(he)(he)間(jian)接(jie)(jie)影響(xiang)(xiang)，并提出了未來研(yan)究的(de)(de)(de)議程，以(yi)避免納米(mi)(mi)/微米(mi)(mi)塑料(liao)污染對(dui)(dui)全球糧食生(sheng)(sheng)產造(zao)成嚴重(zhong)但(dan)尚未被(bei)認識到的(de)(de)(de)威脅。

　　論文鏈接：//doi.org/10.1038/s41467-024-52734-3

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　　2024年9月30日，西(xi)湖大(da)學工(gong)學院雷亮團隊以“Frozen saline sand can be highly permeable”為(wei)題在Geophysical Research Letters發表文章。他們發現，工(gong)程上(shang)用人工(gong)凍結法阻擋尾礦庫或者核(he)電站污染(ran)水(shui)滲(shen)流的措施可能是低效(xiao)甚至無效(xiao)的。此外，地(di)下水(shui)中賦(fu)存的重金屬離子、微(wei)塑料顆粒等污染(ran)物、微(wei)生(sheng)物，甚至溶(rong)解在地(di)下水(shui)的溫室氣(qi)體等都可能沿相互連通的未凍水(shui)通道快(kuai)速(su)輸運。

　　文(wen)章鏈接(jie)：//agupubs.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1029/2024GL111946

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　　2024年(nian)10月2日，西(xi)湖(hu)(hu)(hu)大(da)學(xue)生命科學(xue)學(xue)院(yuan)、未(wei)來產業(ye)研究中心，西(xi)湖(hu)(hu)(hu)實驗室盧培龍團隊與西(xi)湖(hu)(hu)(hu)大(da)學(xue)醫學(xue)院(yuan)陶亮團隊合作(zuo)在Nature Communications?雜(za)志發表(biao)了題為“De novo?design of mini-protein binders broadly neutralizing?Clostridioides difficile?toxin B variants”的研究論文(wen)。該研究“從(cong)頭設計”(de novo?design)了一種廣譜(pu)的迷你中和蛋白(bai)，能夠(gou)以高親(qin)和力結合多(duo)種艱難梭菌毒素B(TcdB)亞型(xing)(xing)，并在細胞及動(dong)物模型(xing)(xing)中表(biao)現(xian)出高效且廣譜(pu)的保護作(zuo)用。

　　文章(zhang)鏈(lian)接：//www.nature.com/articles/s41467-024-52582-1

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　　2024年10月4日(ri)，西湖(hu)大學(xue)醫學(xue)院、西湖(hu)實驗室鄭(zheng)鉅圣團隊聯合中國(guo)疾病(bing)(bing)預防控制(zhi)中心(xin)營養(yang)與健康所(suo)的(de)合作者共(gong)同(tong)在(zai)國(guo)際雜(za)志(zhi)(zhi)Cell Reports Medicine發(fa)表了題為(wei) “The temporal dynamics of gut mycobiome and its association with cardiometabolic health in a nationwide cohort of 12,641 Chinese adults”的(de)研(yan)究論文(wen)，并(bing)入選雜(za)志(zhi)(zhi)當月的(de)封面(mian)文(wen)章(Cover)。該研(yan)究首次(ci)基于萬(wan)人(ren)(ren)級、全(quan)國(guo)性跨地域(yu)人(ren)(ren)群隊列(lie)，全(quan)面(mian)刻(ke)畫了人(ren)(ren)類腸(chang)道(dao)真(zhen)菌的(de)結構(gou)圖譜(pu)及(ji)動態變化。研(yan)究揭示了腸(chang)道(dao)真(zhen)菌在(zai)心(xin)血管(guan)代(dai)謝(xie)健康中的(de)潛在(zai)作用，挖掘出若干(gan)心(xin)血管(guan)疾病(bing)(bing)相關的(de)腸(chang)道(dao)真(zhen)菌，為(wei)心(xin)血管(guan)疾病(bing)(bing)風險(xian)評估(gu)和(he)早(zao)期預警提供了潛在(zai)的(de)新型(xing)生物標志(zhi)(zhi)物。

　　文章鏈接：?//www.cell.com/cell-reports-medicine/fulltext/S2666-3791(24)00518-4

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　　近日(ri)，國(guo)際學(xue)術(shu)會(hui)(hui)議EMNLP 2024論文接收結果公布。西湖大學(xue)工(gong)學(xue)院人工(gong)智能系(xi)張岳實(shi)驗(yan)(yan)室(shi)、藍振忠實(shi)驗(yan)(yan)室(shi)、王東林實(shi)驗(yan)(yan)室(shi)、鄭冶(ye)楓實(shi)驗(yan)(yan)室(shi)共有(you)9篇論文入選。自(zi)然(ran)(ran)語(yu)言(yan)處(chu)理中的(de)(de)經驗(yan)(yan)方(fang)法會(hui)(hui)議(Empirical Methods in Natural Language Processing，簡稱EMNLP)由國(guo)際計算語(yu)言(yan)學(xue)協會(hui)(hui)ACL舉辦，是自(zi)然(ran)(ran)語(yu)言(yan)處(chu)理和人工(gong)智能領域重要的(de)(de)學(xue)術(shu)會(hui)(hui)議之一，在清華(hua)計算機學(xue)術(shu)推(tui)薦列表中認定(ding)為(wei)A類(lei)會(hui)(hui)議。EMNLP 2024將(jiang)于11月(yue)12日(ri)至11月(yue)16日(ri)在美(mei)國(guo)邁阿密舉行。

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　　2024年10月17日(ri)，西湖大學生(sheng)命(ming)科(ke)學學院(yuan)、未來(lai)產業(ye)研究(jiu)中(zhong)心，西湖實驗室謝琦團(tuan)隊(dui)與曹(cao)龍(long)興(xing)團(tuan)隊(dui)合(he)作在Nature Biomedical Engineering雜志發表(biao)了(le)題為(wei)“Targeting overexpressed antigens in glioblastoma via CAR T cells with computationally designed high-affinity protein binders”的研究(jiu)論文。該研究(jiu)基于計算蛋(dan)白質(zhi)設(she)計的方法從頭設(she)計并篩選得到了(le)針對(dui)膠(jiao)質(zhi)母(mu)(mu)細胞瘤表(biao)面的高表(biao)達的腫瘤抗原EGFR和CD276兩個靶(ba)點(dian)高親(qin)和力(li)的迷你結(jie)合(he)蛋(dan)白(Binder)CAR結(jie)構(gou)，同現階段臨床(chuang)(chuang)實驗中(zhong)的相同靶(ba)點(dian)的scFv CAR結(jie)構(gou)相比較，在臨床(chuang)(chuang)前(qian)模型中(zhong)Binder CAR顯著提(ti)高了(le)CAR T療(liao)法對(dui)于膠(jiao)質(zhi)母(mu)(mu)細胞瘤的治療(liao)效果。

　　文(wen)章鏈(lian)接(jie)：//www.nature.com/articles/s41551-024-01258-8

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　　近日，中國(guo)計算(suan)機(ji)學(xue)會(hui)(CCF)推薦的A類(lei)國(guo)際(ji)學(xue)術會(hui)議(yi)NeurIPS 2024論(lun)文接收結果公(gong)布。西(xi)湖大(da)學(xue)人(ren)工智能系19篇(pian)(pian)(pian)論(lun)文被錄用。其中，李(li)(li)子青老師(shi)實(shi)(shi)驗(yan)室(shi)(shi)(shi)(shi)錄用8篇(pian)(pian)(pian)，鄭冶楓老師(shi)指(zhi)導學(xue)生錄用3篇(pian)(pian)(pian)，MAPLE實(shi)(shi)驗(yan)室(shi)(shi)(shi)(shi)、楊林(lin)(lin)老師(shi)實(shi)(shi)驗(yan)室(shi)(shi)(shi)(shi)、李(li)(li)曉飛老師(shi)實(shi)(shi)驗(yan)室(shi)(shi)(shi)(shi)、劉沛東老師(shi)實(shi)(shi)驗(yan)室(shi)(shi)(shi)(shi)、林(lin)(lin)濤老師(shi)實(shi)(shi)驗(yan)室(shi)(shi)(shi)(shi)、吳泰霖(lin)老師(shi)實(shi)(shi)驗(yan)室(shi)(shi)(shi)(shi)、藍(lan)振忠老師(shi)實(shi)(shi)驗(yan)室(shi)(shi)(shi)(shi)各錄用1篇(pian)(pian)(pian)，于開丞老師(shi)指(zhi)導學(xue)生錄用1篇(pian)(pian)(pian)。神經信息(xi)處理(li)系統(tong)大(da)會(hui)(Neural Information Processing Systems，簡稱NeurIPS)與國(guo)際(ji)機(ji)器(qi)(qi)學(xue)習大(da)會(hui)(ICML)、國(guo)際(ji)學(xue)習表征會(hui)議(yi)(ICLR)并稱“機(ji)器(qi)(qi)學(xue)習三(san)大(da)頂會(hui)”。據悉，第38屆NeurIPS會(hui)議(yi)，將于2024年12月9日-15日在加拿大(da)溫哥華會(hui)議(yi)中心召開。

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　　近(jin)日(ri)，西湖(hu)大學(xue)工學(xue)院袁鑫團隊提出(chu)首個低位量化的視頻單(dan)曝(pu)光壓縮成像重建框架Q-SCI。相關工作 “A Simple Low-bit Quantization Framework for Video Snapshot Compressive Imaging”以(yi)口(kou)頭報(bao)告(Oral，接收(shou)率約(yue)為2.3%)的形式發表于計(ji)算(suan)(suan)機(ji)視覺(jue)(jue)頂級會議European Conference on Computer Vision(ECCV)。ECCV會議是計(ji)算(suan)(suan)機(ji)視覺(jue)(jue)三(san)大頂級會議之(zhi)一，錄用論文代表了計(ji)算(suan)(suan)機(ji)視覺(jue)(jue)領(ling)域(yu)2024年最高的學(xue)術水平。

　　代碼(ma)鏈接：//github.com/mcao92/QuantizedSCI

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　　2024年10月，西湖大學生命科學學院、西湖實(shi)驗室(shi)Kiryl Piatkevich團隊與俄羅(luo)斯莫斯科國家研(yan)究(jiu)(jiu)(jiu)中(zhong)心"庫(ku)爾恰托夫研(yan)究(jiu)(jiu)(jiu)所(suo)"的Fedor Subach和美國底(di)特律(lv)韋恩州(zhou)立大學的Alice Walker合作發表的兩(liang)篇(pian)最新(xin)論文中(zhong)分(fen)別報道了(le)名(ming)為NeIle和Thyone的新(xin)型實(shi)用(yong)生物傳感(gan)器，它們給細胞內關鍵生化成(cheng)分(fen)的研(yan)究(jiu)(jiu)(jiu)帶來了(le)新(xin)的突破(po)。NeIle側重于對蛋白質合成(cheng)和代謝(xie)所(suo)必(bi)需的支鏈(lian)氨基酸(suan)的可視化研(yan)究(jiu)(jiu)(jiu)，而Thyone首次實(shi)現(xian)了(le)哺乳(ru)動物細胞中(zhong)硫酸(suan)根(gen)離子動態的可視化，這對許多生理功能(neng)的研(yan)究(jiu)(jiu)(jiu)至關重要。這些(xie)傳感(gan)器代表了(le)生物學研(yan)究(jiu)(jiu)(jiu)的重要突破(po)，為科學探索和潛在(zai)的治療(liao)方法開辟了(le)新(xin)的途徑。

　　(Thyone)文章鏈接：

　　//www.nature.com/articles/s42003-024-07020-9

　　(Nelle)文(wen)章鏈(lian)接：

　　//pubs.acs.org/doi/10.1021/acssensors.4c01055

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　　2024年(nian)10月23日，西湖(hu)大學理學院、國際極(ji)化激(ji)元(yuan)研(yan)究(jiu)中心Pavlos Savvidis團隊在Science Advances上(shang)發(fa)表了(le)題為“Qubit Analog with Polariton Superfluid in an Annular Trap”的(de)研(yan)究(jiu)成果。研(yan)究(jiu)人員開發(fa)了(le)一個新型的(de)模擬量(liang)子計算新平臺，在極(ji)化激(ji)元(yuan)的(de)量(liang)子技術發(fa)展上(shang)又邁進(jin)了(le)一步(bu)。

　　文章鏈接：//www.science.org/doi/10.1126/sciadv.ado4042

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　　2024年10月29日，西湖大學(xue)(xue)生命科學(xue)(xue)學(xue)(xue)院(yuan)、未來產業研究(jiu)(jiu)(jiu)中心(xin)，西湖實驗室裴唯(wei)珂團(tuan)隊和(he)(he)張延曉團(tuan)隊在(zai)(zai)Nucleic Acids Research雜(za)志發表(biao)了(le)題為(wei)“scLTdb: a comprehensive single-cell lineage tracing database”的(de)(de)研究(jiu)(jiu)(jiu)論文(wen)。該研究(jiu)(jiu)(jiu)開發了(le)scLTdb (single-cell lineage tracing database, //scltdb.com)，全(quan)球(qiu)首(shou)個單(dan)細(xi)胞(bao)譜(pu)系示(shi)蹤數(shu)據(ju)庫(ku)。該數(shu)據(ju)庫(ku)旨(zhi)在(zai)(zai)為(wei)研究(jiu)(jiu)(jiu)人員提供強大的(de)(de)在(zai)(zai)線工(gong)具，在(zai)(zai)單(dan)細(xi)胞(bao)水平分(fen)析細(xi)胞(bao)命運和(he)(he)譜(pu)系關系，并預測參(can)與細(xi)胞(bao)命運調控的(de)(de)分(fen)子程序。

　　文章鏈接：

　　//academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkae913/7848853

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　　2024年10月30日(ri)，西湖(hu)大(da)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)醫學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)院 / 生命科(ke)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)院/ 西湖(hu)實驗(yan)室 / 未(wei)來產(chan)業研究中(zhong)心郭(guo)天南(nan)團隊和西湖(hu)大(da)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)生命科(ke)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)院Kiryl D. Piatkevich團隊合作(zuo)在Nature Communications上(shang)發表了空間(jian)蛋(dan)白(bai)組學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)新研究“Spatial proteomics of single cells and organelles on tissue slides using filter-aided expansion proteomics”，介(jie)紹了濾膜輔助膨脹(zhang)蛋(dan)白(bai)組學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)(FAXP)技(ji)術在空間(jian)蛋(dan)白(bai)組學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)中(zhong)的(de)應用。

　　文章鏈接：//www.nature.com/articles/s41467-024-53683-7